碧雲寺原名「火山廟」，俗稱為「新巖」 座落於山靈水秀的台南縣關仔嶺半山腰中，坐東向西，
背倚秀麗的枕頭山，面迎廣闊的嘉南平原，附近林木茂盛；四周碧綠青翠，山林中雲煙縹緲，
與「水火同源」同屬一脈源，地下蘊涵豐富之天然氣，故又名「火山碧雲寺」
關子嶺所在的區域，包括大棟，枕頭兩座山脈。
大棟係嘉南丘陵之主峰，又為南縣山岳中之最高峰；眺望全山，宛如雄獅盤踞嶺上，狀甚壯觀，
其向西北處，稱「獅頭額」。枕頭山位大棟山之前，古稱<玉案山>，又稱<玉枕山>，傍有火山，
根據<諸羅縣志>記載：「火山在貓羅貓霧二山之東山之上，一在玉案山後山之麓」即此處也。
康熙四十年（ 1701），第一代開山祖師<釋應祥>，由福建泉州名剎開元寺奉請一尊觀音佛祖，
渡海來台，從竹仔港（ 今高雄縣永安鄉）登陸上岸，隨後寄居於阿公店（今高雄縣岡山鎮），
數月後為了尋找更適合參禪悟道的環境，再奉迎觀音佛祖遍遊南部各大叢林，最後於枕頭山下
（今白河仙草埔）暫且落腳。
過了數年，應祥禪師發現於枕頭山南麓半山腰有一處靈穴適合靈修參禪； 遂獨自帶著佛祖上山，
披荊斬棘，草建茅堂，即為為本寺之前身。
